Ah! Interessanter Ansatz... 
Mehrere Ideen: 
1.) XT-Organismus: Die Minenarbeiter haben in den Minen einen Organismus/(mehrere Organismen) aufgestöbert/aufgeweckt, der für Zeitraum X inaktiv/schlafend war, und der mit Bärenhunger erwachte, und zusätzlich noch den Drang hat/hatte, sich zu replizieren, mit oder ohne sichtbaren Anzeichen der Art und Weise des Verschwindens der Kolonisten.
Varianten: 
- Der Organismus ist Nanotechnologie. 
- Der Organismus ist symbiotisch. 
- Der Organismus leidet unter rapiden Evolutionssprüngen, liesse sich auch mit den ersten 2 Varianten kombinieren. 
- Der Organismus könnte auch anorganische Materie nutzen, um sich zu replizieren/zu ernähren.
2.) Alientech: 
Die Kolonisten fanden einen selektiv/nicht selektiv wirkenden Doomsday-Device und aktivierten ihn aus Versehen/absichtlich aber unwissend , oder haben ihn beim Untersuchen aktiviert. 
Varianten: 
- DD ist ein Gebäude
- ist ein Fahrzeug
- ist eine K.I. 
- ist eine Waffe
- ist eigentlich nur ein spezielles Werkzeug mit durch äonenlanges Herumliegen bedingter katastrophaler Fehlfunktion
3.) Freakzeug: 
- Der Planet ist ein Organismus und hat Dienerkreaturen. 
- Der Planet war vor Äonenen ein Testgelände und besteht im Kern aus inaktiven Grey Goo Naniten in einem Eindämmungskraftfeld, und dieses wurde beschädigt, z.B. durch Minenarbeiten.
- wandernde Dimensionsrisse zu Paralleluniversen fegen über den Planeten, beeinträchtigen aber nur Organismen, aber keine tote Materie. 
- Cthulhu verschlang ihre Seelen und liegt nun schlafend im Inneren eines tiefen Berges. 
So, das wars fürs Erste.
Twist: Das Erz sind inaktive Naniten, die aus besagten Elementen bestehen, und die durch den Scan aktiviert wurden.